“陛下，也许您应该再考虑一下，我们到现在为止还没有证明，牛痘是否对天花有预防作用，也不清楚它是否对人体有害。再我看来，您应该推迟接种牛痘的实验，直到我们能证明它足够安全。”
邓玉函在做好了接种的准备之后，忧心忡忡的再次对崇祯进行了劝谏。
他倒不是担心崇祯接种牛痘之后，会出现什么不良反应。他是担心当崇祯出现不良反应之后，那些一向敌视他们这些天主教传教人士的士大夫们，会不会有什么过激的反应。
毕竟当初这些士大夫们仅仅以一个谣言就制造了南京教案，把天主教的传教士们都赶到了澳门去。
但是在太医院的太医们拒绝为皇帝接种牛痘之后，大明皇帝让他来替自己接种牛痘，这无疑是一个成为皇帝亲信近臣的好机会。
只要牛痘接种成功，那么代表着西洋传教士找到了一条如何接近皇帝的途径，他们将不需要再通过徐光启等中国士大夫们，去间接施加对于皇帝的影响。
但是信心满满的邓玉函，现在却显得犹豫不决，完全是因为房间外面，那一阵阵的反对皇帝接种牛痘的声音。
太医院的太医们都跪在了太医院内，对着几名锦衣卫守卫的，门扇紧闭的房间，涕泪交织的大声阻止着。
朱由检侧耳静听了一会，就对着邓玉函说道：“中国是一个有着悠久历史的国家，虽然大明开国不过200多年，但是我们日常的行为礼仪和道德标准，却是来自于2000多年前一位贤人建立的学说。
就好像你们认为的古希腊文明深深的影响了你们的生活一样，这位叫孔子的贤人推崇的伦理道德，现在依然掌控着大明的道德标准和伦理秩序。
想要在这样庞大而古老的文明国家之中推行一样新事物，重要的不是同那些反对者辩论，而是要用事实去证明，新事物是有益的。
邓先生，牛痘的接种技术同你热爱的解剖学一样，只有让民众先了解了它们的好处，才能消除他们对于新事物的恐惧。”
朱由检努力说服邓玉函的时候，连善祥同王承恩正紧张的监视着这个一脸大胡子的西洋番人的举动，唯恐他会做出有害于皇帝的举动。
邓玉函纠结了一会，终于还是忍不住对于接种牛痘的好奇心，同想要获得这位异教徒皇帝的好感，他努力使得自己接受了崇祯对于他的说服。
当黄立极带着内阁成员及九卿重臣匆忙到太医院的时候，正好看到皇帝从房间内走了出来。
黄立极有些气急败坏，他今日正召集群臣讨论公推入阁的人选。结果会开到一半，突然就传来这几天安分的待在宫内的皇帝，居然跑去太医院接种牛痘了。
这让内阁及九卿大吃一惊，更为让人惊讶的是，皇帝几天前就通知了太医院，而这些迂腐的太医院的医官们，只顾着讨论皇帝接种牛痘有没有危险，居然没有一个人想着要先同内阁汇报一声。
看着崇祯从房间内走出来，黄立极顿时迎了上去，他匆匆带着群臣对着皇帝行礼之后，就赶紧带着希望说道：“陛下，您现在应该没有接种什么牛痘吧？”
崇祯一边招呼着院子内的太医们起身，一边对着首辅满不在乎的回答道：“朕已经接种完成了，黄先生，你可能不知道，接种牛痘原来是件很简单的事。如果这样就能预防天花的话，那么大明的百姓今后将不必再担忧天花恶疾的传播了。”
黄立极顿时头有点晕，他有些顾不上君臣的礼仪，对着崇祯提高了声音责怪道：“陛下如何能如此轻佻，这牛痘尚没有证明对天花是否有效，也没人知道它是否对人有坏处。
要是陛下的龙体出了什么问题，将置大明社稷于何地？来人，把那个蛊惑陛下行事的西洋妖人拿下，还有这些太医院的医官们，劝阻皇帝不力，都先收押起来。”
黄立极愤怒之下，顿时把矛头对准了，替崇祯接种牛痘的邓玉函和这些医官身上去了。然而院子内的锦衣侍卫们却对于首辅的命令充耳不闻，几名侍卫武官都紧紧的关注着崇祯的指令。
“黄先生真是太爱说笑了，这接种牛痘是朕的意思，怎么能怪到旁人身上去。不管如何，朕现在都已经接种了，黄先生你再发火，时间也不能倒退啊？
朕倒是觉得，接下来几天朕小心观察自己的身体会不会不适就可以了，没必要兴师动众。现在京畿连续发生了两次变乱，正是宜静不宜动。
如果黄先生在太医院掀起大案，京中要是有人借此妖言惑众，那岂不是搬起石头砸自己的脚了吗？朕看，这件事就到此为止，黄先生还是和众卿回去办自己的事，这边让太医院继续研究牛痘的事，你看如何？”
在崇祯始终冷静的劝说下，黄立极终于带着内阁和九卿离去了。朱由检这才对着太医院的院使、院判吩咐道：“如果三天后，朕的身体没有异常，就先对救济院的儿童接种牛痘。
让内医局派出几名女医官协助并学习接种牛痘的技术，准备对宫内人员进行接种牛痘。”
看着几名医官连连点头之后，朱由检又继续说道：“天花这类恶疾一定不会凭空出现。朕看过的书中，有人说但凡瘟疫之类的恶疾，都是因为居住环境恶劣和食物、饮水不洁净所导致。
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